圣法兰西斯卫理公会教会学校开设多种世界认可的中学及大学预科课程，包括剑桥“O”水准、伦敦IGCSE、国际伦敦“A”水准，以及9-12年级的澳大利亚初中与大学先修班课程。学校还与英国的大学合作提供大学衔接课程，如BTEC高级大专商业文凭课程，以缩短学生的学术道路。圣法兰西斯卫理学校为选择接受独特教育机会的学生提供培育性的和全能的教育。